应用软件出问题是很常见的事，会中断正常使用，有时还会造成资料损坏。这类情况的发生，可能是软件本身有缺陷，也可能是系统与软件不匹配，又或者是电脑里有病毒。当应用软件出故障时，很多人会觉得烦恼，因为它常常会干扰工作和休闲活动。
软件自身存在缺陷，是造成应用出现故障的普遍因素。设计者在制作程序时，常常会有一些小差错，使得软件在执行时产生状况。有些游戏软件，在版本升级后，可能会因为程序的改变，导致各种反常现象，让使用者无法顺利进行游戏。此外，一些不太知名的软件，因为测试不够充分，更容易碰到这类状况。
系统同软件互相不协调，也会引发程序出现故障。操作系统持续升级，部分早先设计的软件，在较新系统里，或许没法正常运作。比如，某些多年前制作的软件，在Windows 10或者更新系统上，就可能显现出配合不畅的情况，让程序没法开启，或者在使用时产生错误。对于需要用老软件完成特定任务的人，这种情况会带来不少麻烦。
电脑里的有害程序同样会阻碍软件的正常工作。病毒、木马这类有害程序会毁坏软件的内部构造，更改程序里的信息，因此造成软件出错。